Cell | 确立人类树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

细胞会-细胞会化学键诱发繁复，涵盖大量小分子与波形移动式，学界钻研多年，仍旧是管中所窥豹。来自法国巴黎PSL数据集统计分析私立大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上刊出题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的社论，成立了检验与概念借助于的数据集统计分析方法，检验上，在酵素低水平检验了细胞会所排泄的细胞会因子与应激反应；概念上，成立了波形输入转换成之间的联络和化学键父子关系。所写以本能神经节状细胞会（Dendritic cell，简写DC）与这两项T细胞会（T Helper cell，简写Th）之间的化学键为数据集统计分析具微来说，统计分析了36同上DC关的的波形小分子和17种Th排泄的细胞会因子，并倚靠这些数据集成立数学仿真，演算出56种不太确实被检验得出结论的细胞会相互父子关系，与此同时，还推论出290种确实父子关系，并得出结论了IL-12p70可以通过IL-1波形移动式其会17型这两项T细胞会（简写Th17）。首先，所写采集了本能单核会来源的DC（MoDCs）和锥微肾脏CD11c+DC（bDCs）两类细胞会，并诱发24小时。所引入的诱发波形主要值得注意三大类总计14种。第一种：内源波形小分子，都有干扰素beta（interferon β，简写IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样介导的配基，都有Toll4介导的拮抗剂脂多糖（ lipopolysaccharide，简写LPS），Toll1/2介导拮抗剂PAM3CSK4，Dectin1拮抗剂Curdlan，Toll2/Dectin1拮抗剂 zymosan，Toll7/8介导拮抗剂R848，Toll3介导拮抗剂 poly(I：C) 和NLRP3炎症小微活化剂铝钾；第三种：细菇病毒，都有高温灭活的Candida albicans （简写HKCA），李斯特菇（Listeria monocytogenes，简写HKLM），Staphylococcus aureus （简写HKSA）， Streptococcus pneumoniae （简写HKSP）和HIV（influenza virus，简写flu）。最后，所写通过流式细胞会妖术等方法，检验了36种DC关的小分子的传达持续性，其中所，29种处于细胞会微小，7种处于细胞会排泄上清中所的。结果表明，除了一些可知的DC细胞会组织起来之外，所写还有了一些取而代之找到：（1）zymosan诱发的MoDCs 传达上佳的CD54 和PVR；（2）HIV诱发的MoDCs可以其会ICOSL；（3）LPS诱发的MoDCs 可以其会上佳的CD30L和CD83。再下来，所写将这些诱发过的DC与T细胞会粗略估计6天，随后检验Th的细胞分裂成本以及17种Th关的细胞会因子的传达排泄持续性。引人注目的是，所写将Th和DC的展现相互相对，找到，这二者之间并不存在双射的父子关系，也就是说，两种诱发物对DC归因于的优点类似于，但是，这两种诱发物所处理的DC与T细胞会粗略估计之后，归因于的优点很可以大相迳庭。接着，所写引入生物文档学的方法，以上述检验数据集成立仿真。简单来说，所写整微DC转换成的36种波形小分子和Th转换成的17种effect小分子，将两两之间的父子关系细化为“正向管控”和“一般而言管控”两种，并且，还投身文档和已刊出文献中所的文档，成立了繁复的波形管控互联。同上如，通过这一仿真，所写找到， IL-10的一般而言管控小分子都有OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而正向管控小分子都有Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给与DC不同的诱发波形，所写就可以推断Th组织起来细胞会IL-10的传达排泄持续性。最后，所写利用这样仿真，借此推论并得出结论取而代之细胞会相互父子关系。通过成立的仿真，所写找到，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2协同排泄时，倾向于管控IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 协同注意到时，则更倾向于管控IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的传达低水平都显着降低。这些结果说明，IL-12参与Th17的其会分化。为了更进一步探讨IL-12其会Th17的前提，所写引入游离其会Th的仿真，找到，IL-12并不能实际上其会Th17，但是，同时投身IL-1和IL-12，Th17就其会出来了。这是一篇检验与概念借助于的经典之作。检验结果与计算出来建模相互支持，相互范本，相辅相成。如下绘出所示，检验大部分引入了密切联系关联两大部分数据集，一是何种诱发下DC细胞会的组织起来，二是组织起来后的DC对T细胞会的作用。概念大部分以DC和T细胞会的转换成细胞会因子为内部，成立了细胞会因子之间的正向和一般而言管控互联仿真。通过这一仿真，所写才会有一些取而代之细胞会间相互父子关系，之后再用检验得出结论这些父子关系否属实。这篇名的亮点有两处，一是成立和检验概念借助于数据集统计分析的范本，二是社论中所提供的诸多细胞会管控文档以供数据集统计分析参考。原始出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.