已有的分析显示,许多复杂的有机体变异,包括疾病,都表现出持续性倾向差异的构造。这些持续性倾向差异被各有不同高度地并不认为荷尔蒙、持续性线粒体、蛋白质型×持续性倾向效应、行为差异和自然环境暴露的差异。然而,至今为止,它们的系统和整体病理学基本概念在较大高度上始终是难以确定的。
蛋白质型-有第三组织表达出来(GTEx)项目提供了一个但他却,让我们可以通过分析许多直到现在未曾以这种模式比如说的有第三组织,来冒险有机体表型出来第三组当中持续性倾向差异的普遍持续性和表型系统。
在在,分析执法人员在Science杂志贴出。为了比如说有机体表型出来第三组及其抑制的持续性倾向差异,并发掘出持续性倾向和生物化学如何两者之间互影响复杂的变异和疾病,分析执法人员在GTEx项目(v8资料发布)调查的44个有机体有第三组织来源当中聚合了表型出来及其表型抑制的持续性倾向差异目录,并分析了16245个RNA测序样本和838个成年个体的蛋白质型。
在此基础上,分析执法人员通报了表型出来水平、有第三组织细胞一般来说第三都是由和顺式表达出来定量变异启动子(cis-eQTLs)的持续性倾向差异。为了审计它们的影响,分析执法人员将这些结果与87个GWAS的蛋白质整体功能、表型出来启动子两者之间结合译文和全蛋白质第三组关联分析(GWAS)汇总统计数字两者之间两者之间结合。
结果显示,持续性倾向对表型出来的影响是无处不在的 (在所有有第三组织当中,分析执法人员鉴定了13 294个有持续性倾向差异的蛋白质)。然而,这些影响很小,而且主要是有第三组织选择持续性的。
具有持续性倾向差异表达出来的蛋白质主要不是由有第三组织选择持续性表型出来驱动的,而是参与了一系列大众化的生物整体功能,如药品和激素反应、胚胎发育和有第三组织型态发生、受精、持续性生殖和精子发生、脂肪代谢、癌症和病原体等。
而X连接蛋白质在女同持续性恋当中表达出来更高,查看了逃避X线粒体失活的候选蛋白质,常线粒体蛋白质的持续性倾向特别强调持续性表达出来查看了与激素两者之间关的表型出来启动子抑制和额外表型出来启动子的效用,以及密切相关生物化学标记的持续性倾向差异持续性分布,特别是鸟嘌呤H3 Lys27三特异持续性(H3K27me3)。
表型出来的表型抑制的持续性倾向差异要少得多(在所有有第三组织当中鉴定出了369个持续性倾向特别强调的eQTL),并且具有水平的有第三组织选择持续性。分析执法人员发掘出了58个由单一持续性倾向的表型出来表型抑制驱动的蛋白质-变异关联。这些包括持续性倾向差异的细胞一般来说稀土元素介导蛋白质型-变异关联的启动子,以及持续性倾向可能在关联的潜在分子系统当中发挥更实际上效用的启动子。例如,分析执法人员在肝脏当中发掘出了一个女同持续性恋选择持续性的六激酶HKDC1的eQTL,它影响怀孕女同持续性恋的代谢,随后凸显在后代的出生身型上。
因此,通过将GTEx资料的持续性倾向意识分析与蛋白质整体功能和表型出来启动子两者之间结合译文两者之间联合,分析执法人员描述了导致有机体表型出来第三组和eQTLs持续性倾向差异的有第三组织选择持续性和有第三组织两者之间关联的驱动因素和系统。
分析执法人员发掘出了多个持续性倾向差异的表型出来效应,这些效应与复杂的变异表型关联共轭,从而促进了GWAS频谱的机理推论。
由于许多变异的致病有第三组织是难以确定的,因此对大众化的GTEx有第三组织收集的分析可以作为调查持续性倾向偏倚变异基础的强大森林资源。这项实习对有机体表型出来第三组的持续性倾向差异及其表型抑制进行了广泛的比如说。
原始引自:
Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066
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